许多细菌的荚膜物质融合成团块，内含很多细菌，称为菌胶团。菌胶团是污水处理中，细菌的主要存在形式，在一些不适宜原生动物生长的污泥中，则通过看菌胶团的大小以及数量来判断处理效果。菌胶团在废水处理中具有 重要意义：
(1)可以防止细菌被动物吞噬;
(2)可以增强细菌对不良环境的抵抗，如干旱等;
(3)菌胶团具有指示作用：新生的菌胶团，具有良好的废水处理性能， 主要表现在其结构紧密，吸附和分解有机物的能力强，具有良好的沉降性。
老化的菌胶团，结构松散，吸附和分解有机物能力差，沉降性差。颜色上， 新生的菌胶团颜色浅、甚至无色透明，老化的菌胶团颜色较深。
通过显微镜观察，我们可以根据下列因素来判断菌胶团性状：
(1)菌胶团的数量
以现有的情况计数，视一定体积内的菌胶团的密度而定，受取样、污泥浓度等影响，一般难以正确分析，正常时一般不做描述，只有在发生较大变 化时进行记录。
(2)菌胶团的形状
根据菌胶团的形状将其描述为四种形态：球形，不规则形，开放，封闭。真正的球形絮体在活性污泥中是不存在的，通常将近似球形的菌胶团称为“球形”。如果形状非常不同与球形才被称为“不规则形”，这时在菌胶团侧面有大的突出。在一个封闭的菌胶团中几乎没有开放的空间，相反在一个开放的 菌胶团中，菌胶团的一部分通过一个空间清晰地与另一部分分离。
(3)菌胶团的紧密度
紧密度用弱和强来表示。在紧密度弱的菌胶团中，细菌细胞的结合很低缺乏一个紧密的中心，这种菌胶团轻压盖玻片的侧面很容易被破坏。菌胶团与液体之间没有明显的界限，因为其边缘有许多细胞既在液体中也在菌团中。通常明显的有很多分散的物质。
在紧密度强的菌团中，细菌细胞的结合强，菌胶团和液体之间有明显的界限，紧密度强的菌胶团有时形成尺寸较大的，结实的颗粒状絮体，在显微 镜下观察时由于污泥粒径大、透光率低，所以多呈现出黑暗图像。
(4)菌胶团的尺寸
按直径大小分为：大(d>500μm)、中(150μm
(5)菌胶团的组成
菌胶团组成主要指：老化污泥多少、菌胶团形状及大小分布、是否有无 机颗粒和非生物有机颗粒、颜色等。
污泥老化程度是指活性污泥中死亡的细菌细胞所占比例。新生菌胶团颜色浅、无色透明、结构紧密，生命力旺盛，吸附和氧化能力强;老化的菌胶团颜色深、结构松散，活性不强，吸附和氧化能力差。根据观察到的污泥老 化程度来调节剩余污泥排放量，使菌胶团处于最佳活性状态。
菌胶团形状及大小各有不同，从一定程度上也反映了菌胶团细菌种类的 丰富，种类丰富的菌胶团在水质发生变化时具有更高的抗冲击能力。
菌胶团颜色发黑，可能是曝气池溶解氧不足;菌胶团色泽转淡发白，则可能是曝气池溶解氧过高或进水浓度低负荷过低，污泥中微生物因缺乏营养 而自身氧化。
4活性污泥镜检图
污水处理厂正常运行状况下，活性污泥的絮粒大、边缘清淅、结构紧密，呈封闭状态、具有良好的吸附和沉降性能。絮粒以菌胶团细菌为骨架，穿插生长一些丝状菌，但丝状菌数量远少于菌胶团细菌，微型动物以固着类纤毛虫为主，如钟虫、盖纤虫、累枝虫等，还可见到楯纤虫在絮粒上爬动，偶尔 还可看到少量的游动纤毛虫等，轮虫生长活跃。
污水处理厂运行出现异常情况时，污泥出现絮体结构松散，絮粒变小，观察到大量的游动型纤毛虫类(豆形虫属、肾形虫属、草履虫属、波多虫属、滴虫属等)生物、肉足类生物(变形虫属和简便虫属等)急剧增加的生物相，出现这种生物相时，污泥沉降性差，影响泥水分离。
要了解污水处理过程的变化或处理水的好坏，最好直接研究分析细菌的生长情况。但是对于细菌的观察、分类鉴定的时间很长，不能及时起到指导生产的指示和预报作用。微生物与细菌之间存在相互依存的功能关系;微生物个体大，便于观察;对于环境变化比细菌敏感，更早也更容易反映环境的变化。直接观察微生物的种类组成、数量、生长和变化状况，也能反映出细菌的生长和变化情况，即间接地评价污水处理过程和处理效果的好坏，起指 导生产的作用。
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